对我国而言，商务带来的最大挑战不是技术，而是政策的一致性和制度框架的设计问题。电子商务的出现，对交易过程的全链条中过去适用于传统交易方式的、制度均提出了挑战，何况我国计划体制下条块分割、行政分权的明显残留物，导致了难以形成一个跨部门的、一致性的政策框架。
电子商务引出的政策问题包括：
税收和关税问题。虽然电子商务的出现，不能改变原有的课税和关税原则，但必须建立与电子商务相适应的税收、关税征稽系统和制度。
相关的法律问题。主要有：电子合同的法律效用；传统交易方式中具有法律效用的原始合同、签名等如何在电子介质中；纠纷出现后电子形态的证据如何被法庭所接受，等。
安全问题。主要有：交易主体的身份识别；交易过程的商业秘密；电子通讯的安全，特别是未经授权的中途拦截和篡改；交易和其它记录的保存和管理，等。
如果不采用有效的加密技术电子交易是极不安全的。和消费者必须建立在相互信任的基础上其交易行为才可能实现，而相互信任的基础是交易过程的安全保证、保密（对消费者而言是其信用卡详细信息的保密，以免被他人盗用）、受法律保护，而这些只能通过政府颁布安全标准、建立安全制度和安全系统才能实现。否则，电子商务的将受到严重的制度制约。
电子支付系统的建立和协调。
消费者权益以及个人隐私权的保护。信息技术的发展使得未经许可采集、、使用个人信息变得十分容易，从而存在个人隐私被侵犯的潜在风险，为此必须制定相关的法律法规。
知识产权的保护。
电子商务活动的真实统计以及政府的宏观管理。
从全球情况看，电子商务的发展普遍快于政府政策、标准、法律的建立、修改和完善。就我国而言，虽然电子商务仍处在导入期的初始阶段，但由于法律法规缺陷较多，这一问题更为突出。提出电子商务引出的政策层面的问题，并不意味着只有等政府的政策、法律、制度完善以后才能发展电子商务，而是面对能够显著提高运行效率的新生事物，如何适时、合理地制定、完善、修正相关的政策和法律，尽快消除制约电子商务发展的政策和制度瓶颈，促进电子商务的健康、快速发展。
总体而言，政府在促进电子商务发展中的作用是建立和完善基础设施和软环境：一是建设快捷、价廉的物理通信通道——互联网；二是构建适宜电子商务成长和发展的政策和法律软环境，以及相关配套体系的建设，如电子货币、银行电子支付系统的建设。
当前急需要的政策选择是：
第一，由于电子商务涉及生产、、税务、物流、贸易、法律等众多政策问题，建议指定并授权国家经贸委为协调机构，并参照发达国家的经验，尽快制定发展电子商务的总体政策框架，并组织政府相关部门有重点地制定操作层面的政策、标准、法律法规。
第二，重点制定安全性标准和安全性法规，同时对消费者权益的保护要作出相应的
第三，采取引进和消化吸收相结合的方式，逐步掌握电子商务的关键技术。
第四，通过宣传、培训工作，引导企业对企业、特别是大型企业）的电子商务发展，使企业对企业、企业对消费者的电子商务协调发展。