权责发生制是指这样一种会计确认基础：凡是当期已经实现的收入和已经发生或应当负担的费用，不论款项是否已经发生，都应当作为当期的收入和费用；凡是不属于当期的收入和费用，即使款项已在当期收付，也不应当作为当期的收入和费用。我国事业单位会计核算基础由目前实行的收付实现制改为权责发生制，已是一项十分紧迫和必要的课题，本文拟就其必要性和主要改革措施作一探讨。
一、事业单位现行收付实现制核算基础的弊端
1、不利于进行成本核算、提高效率和绩效考核。收付实现制以款项是否收付为标准入帐，当收益实现和收到款项时间不在同一期间时，会计记录便不能代表当期业务活动的真实结果，同理，当费用发生与支付不在同一期间时，会计记录也不能正确反映当期业务活动所支付的代价。因此，收付实现制不能公正、客观地核算成本和反映运营结果。
2、不能全面准确记录和反映单位的负债情况，不利于防范财务风险。收付实现制下的财务支出只包括现金实际支付的部分，不能反映那些当期虽已发生但尚未用现金支付的债务，单位的负债和一些隐性债务不能得到反映，不利于防范未来的财务风险。
3、收支项目不配比，不能真实反映当年收支结余。收付实现制以现金收付为标准确认收入和支出，造成一些本期收益已经实现，但由于款项尚未收到以及实际已经开支，但款项尚未支付而不能列收列支，或者将应在几个会计期间列收列支的项目，在一个会计期间列收列支，造成项目之间不配比，无法真正反映当期收支结余，各期之间收支规模波动性很大。
4、不能真实反映对外投资业务。收付实现制在投资时作一项资产的增加和另一项资产的减少，到收回时才一次确认为收益，也不计提减值准备，无法反映各期的投资收益，有的长期投资在几年内只反映其成本，不能反映投资的真实情况，不利于加强投资管理，评价投资的效益。
5、不能反映固定资产的真实价值。由于目前事业单位固定资产不计提折旧，无法反映固定资产的实际净值，不能在费用和成本中反映资产的耗费，以至固定资产帐面与实际价值严重背离，不能真实反映单位的固定资产状况。
6、会计报表信息不完整，项目列示不科学。比较严重的有：基本建设支出不在财务总帐中反映，而是单设基本建设帐，总帐上只是反映一个结转自筹基建数，在建工程的进展情况、投入情况无法知晓；另外资产负债表和收入支出表中同时反映收支项目，既不符合资产负债表作为静态报表，不应反映收支类科目的属性，又因重复列示而无意义等等。
二、改为权责发生制的思路和主要业务处理
事业单位会计核算基础改为权责发生制，就目前状况而言，不可能一蹴而就，应采用渐进式的改革，逐步推进。但是，我们必须以权责发生制的要求对那些主要的、条件比较成熟的会计业务处理进行改革，使我国事业单位的权责发生制改革迈出实质性的步伐。现将一些主要会计业务的处理作如下建议：
（一）收入的权责发生制处理
事业单位的预算外收入，包括劳务接受人应交未交的费用，应按提供劳务的期间，将实收和应收的款项均确认为应上缴专户的财政性资金（仍然不得确认为本单位的事业收入，但经批准可不上缴的除外），借：现金（银行存款）贷：应缴财政专户款，或者借：应收账款 贷：应缴财政专户款。“应缴财政专户款”科目贷方反映按照权责发生制应上缴财政专户的全部预算外资金，借方反映实际上缴财政专户的预算外资金，余额反映应缴未缴的预算外资金。
（二）支出的权责发生制处理
对支出业务，应按权责发生制列为收益期间的支出，对于跨月、跨年支出应按收益期间，采用一定比例合理划分，进行分摊；对实际劳务已经发生，款项尚未支付或完全支付的事项，应当按照劳务或购货实际时间列报支出，借：事业支出 贷：银行存款（或应付账款）。
(三) 对外投资的权责发生制处理
对外投资包括债权性投资和股权性投资，应当按照权责发生制确认投资成本和投资收益，不能在投资收回时一次性确认收益。如购买债券，利息的确认应当分月确认投资收益。股权性投资应当采用成本法或权益法参照企业会计制度确认投资收益或损失。确认利息收入时，借：其他应收款—应收利息 贷：其他收入—利息。