内部控制制度是发展到一定阶段的产物，是企业管理的重要手段。在信息产业十分发达的当今社会，有效的内部控制不仅能促使企业资源合理配置，提高劳动生产率，而且对于防范舞弊、减少损失、提高资本的再生能力具有积极的意义。
众所周知，市场经济发展到今天，企业的外部环境、内部结构等都发生了巨大的变化，企业之间的竞争更加激烈。企业是所有者、经营者、政府、债权人以及消费者和公众之间的契约，在这一契约中，客观公正的资料有着纽带和桥梁作用。企业在建立了电算化会计系统后，会计核算的速度以及准确性和可靠性都得到了极大提高，同时也为企业内部控制带来了许多新。在新的经济条件下企业内部控制将发生以下变化：
第一，企业内部控制的组织机构将改变。金字塔式、自上而下控制的组织形式，将转变为扁平化、化、民主化的组织形式。新经济要求企业不断创新，这需要个人、部门之间高效率地合作，需要有强烈的团队意识和团队精神。企业内部控制不是更多地基于权力的需要，而是基于信息的性和企业健康发展的需要。在新经济下，企业内部控制层次明显减少，但责任更明确，效率更高。内部控制通过每个人与组织建立起合适的“视窗”进行，内部控制的透明度也大大增强。
第二，企业内部控制的方式也将改变。工业经济时代的企业内部控制方式是高层控制低层，一层控制一层。而在新经济时代，网络可以及时传递信息，而许多知识和重要信息主要分散在企业的基层，存在于专家的头脑中，故企业内部由基层建立起各种类型的控制小组，将是实行自我控制的最佳控制方式。
第三，企业内部控制的范围有所扩展。传统工业经济时代的企业内部控制侧重于内部管理。随着信息技术的发展，企业与客户之间、企业与国家之间可以共享所有的资源。过去边界明确的现象逐渐消失，企业内部控制的范围不再局限于企业内部，完全可以通过网络进入合作伙伴的信息系统，实现内部控制的外部化、宏观化。
第四，企业内部控制程序由顺序化向并行化发展。在新经济时代，由于网络的普及和普遍采用视窗工作方式，工作空间上的可见和时间上的接近不再是至关重要的问题，这样内部控制可以由顺序化向并行化发展。通过这种方式可以使企业的设计、销售、工业工程人员并肩工作，共同控制企业的物流和信息流，控制企业的资金流量和流向。
第五，企业内部控制关系也将发生明显变化，由命令与控制向集中与协调转变。在工业经济时代，企业内部等级非常明显，工作先按过程分解，然后通过命令和控制再将其进行连接，指令往往来自企业上层。在新经济时代，企业通过网络可以很方便地使内部人员之间及与外部人员之间平等、动态地进行协作和沟通。企业中每一个人都是网络中的知识贡献者，都可以成为企业控制网络上的决策点或节点，都可以尽可能地作出自己最大的贡献。
新的经济条件的变化，使企业内部控制的组织机构、控制方式、控制范围、控制程序、控制关系随之产生变化。为了适应新的经济条件的变化，原有的内部控制制度必须进行创新。笔者认为，企业内部控制制度的创新可从以下方面进行：
第一，建立新型的资金供给制度，最大限度地满足创新、管理创新和经营创新的需要。企业的科技创新、管理创新和经营创新都需要大量风险投资基金的支持，而原有的资金供给制度难以满足企业创新活动的需要，企业资金供应渠道必须实现多元化，这就需要从制度上进行彻底更新。
第二，建立新型的成本、费用控制制度。在新条件下，不能沿用传统的成本、费用控制制度，那将限制科技创新活动的开展，也不利于发挥各部门和个人的专业特长。新经济是建立在开发式、竞争性的市场上的，更加注重科技成果的创新和产业化。我们传统的成本、费用控制往往与科技创新、市场价值相脱节，单纯追求费用的节省和成本的降低。因而，成本、费用控制制度的创新显得非常重要。成本、费用控制制度要面向市场、面向未来，要做到产、学、研良性互动。政府应当制定一些规范性、指导性的成本、费用控制制度，具体如何操作，企业可以根据实际情况，灵活加以运用。比如，在许多不成功的项目上投资，花费了大量的成本、费用，在传统经济下，企业的内部控制制度是不允许的，而在新经济条件下，这完全是正常现象，不必大惊小怪。