但是由于其有执行跨期较长的特点，期间的变化可能较大，很难预计和判断，且执行中监督困难等因素，如果供应商不诚信，监管措施又未跟上，协议供货将成双刃剑，轻者导致政府利益的损失，降低政府采购的效果，大者将是陷于供应商的骗局，完全背离政府采购的宗旨和协议供货的本意，损害政府采购的声誉，有百弊而无一利。
我们不能因为协议供货存在的问题，而完全否认其作用，但也必须重视其存在的问题，所以在肯定协议供货办法的必然性、科学性、现实性的同时，探讨如何做好协议供货，使其真正发挥作用，是一个很重要的课题。
存在问题
在招标竞标时，为争取中标，各供应商在质量、价格和服务方面承诺是体现实力的，但中标后在执行期限内，则质量变差、价格变高、服务下降，存在如产品以次充好，取得定点权后垄断市场，价格变本加厉，获取暴利，有的定点供应商互相串通抬价，有的因定点业务量大，无力完成而私自分包坐吃回扣等。政府采购管理机构工作很被动，无法有效监管，力不从心。导致的结果是根本背离政府采购的宗旨和协议供货的目的。
如何去解决这些问题呢？这要从两个方面，一要树立正确的协议供货理念，一是采取切实有效的具体措施。
协议供货管理应树立的几个理念。
协议供货是政府采购的一种管理方式，都是在节支增效这个大宗旨下的选择和决定，这是最终目标，违背此就是失败的，就应作完全的根本的否定。应将政府采购的宗旨和原则，贯穿于协议供货的招标、评标和中标后的管理过程中。
协议供货合同生效后，并不就是在期限内一定要按合同执行，也不是仅仅执行投标时的承诺，如果期间出现有违背《政府采购法》规定的原则的，可强行中止合同或对合同补充和修正。如必须在定点期内都保证其价格、质量和服务较市场的有利性。
协议供货，重在监管，监管的思路和举措不能是在事后体现，被动选择，有的要在事前体现，体现在招标方案、评标规则中。供应商的诚信度是协议供货成败的关键。
实行范围
协议供货有很多作用，能解决很多采购中的问题，采用协议供货，不同的货物和服务出发点是不一样的，如电脑、打印机和空调等，主要是出于解决采购频率高、高采购成本和低效率的问题，车辆保险、车辆维修、办公用纸等，主要解决规模和采购效果问题，医疗设备、环保设备等专用设备，主要是解决规模和定品牌难有效招标问题。协议供货的方案，在解决了这些问题后，主要需考虑两个“度”，一个是协议供货的期限，一个是协议供货的区域范围，其确定需对各相关因素作具体分析后判断，如专用设备，可在全国执行，计算机、打印机则最多到省级，最好在地市级范围，而车辆保险、办公用纸等则在县级范围才是现实的，而很多内容则不适合采用协议供货。总之，在制定协议供货方案时，不能贪多贪大，需从效果和管理能力两角度去考虑和分析。
加强组织和管理的对策
招标中具体承诺和原则承诺相结合。不管期间内容是否会有变化，和合同是否有冲突，《政府采购法》规定的原则和要求，都必须在协议供货期内执行，其是前提条款，如须保证其质量、价格和服务较当时市场上的有利性，这条原则要求需在招标文件中列出，也是供应商必须承诺的原则，和投标具体承诺相配套结合。实际执行违反此原则的，则可强行中止合同，或对供应商进行处罚。
招标方案中要有原则要求，还要有具体的可操作性的有利于执行监管的要求。这体现强制接受和监管的需要，并在招标方案中体现。现行的招标采购方案中，这方面未予重视，未结合实际工作的必要，提出一系列明确的有利于对质量、价格和服务等监管的要求，造成监管工作的被动和无奈。如对以市场价为基数加上优惠率的招标方式，为保证其提供市场价的公开性、真实性和及时性，可强制要求供应商在专门媒体上每天发布市场信息，有专人负责，即使未有变化的，也要重新确认过。公开接受各方的监督和投诉。