（三）工程项目经济效益审计通常采用的方法
1、审查复核法 就是对被审计单位所提供的和审计人员收集到的各种资料，运用审计人员的专业技术知识与经验，在核实其提供的会计记录的真实性、完整性、合法性和一致性的基础上，进行合理的推断、验证、计算，通过审计人员理性的分析与复核作出具有证明力的审计结论。
2、对比分析法 根据一定的标准，将预算数或计划数与实际数从定量的方面进行对照比较，分析其异同的分析方法。在工程项目经济效益审计中对比分析法贯穿于审计活动的始终，在审计分析中占有重要地位。对比分析法中常用的方法是比率法，可以通过百分比、绝对比、相对比等，视具体情况作出一种或几种的选择进行比较与求证，以保证审计结果的客观真实性。同时，在选用对比分析时，要正确把握事物的本质及其规律，选用最适合的对比方式，然后才能运用分析方法实施具体分析。常用的方法主要有以下几种：纵向对比、横向对比、计划与实际比、整体与部分比和综合对比。
3、观察法 是审计人员对被审计的工程项目进行的实地察看。观察是审计人员利用其视觉功能检查行为结果和实物资产存在的状况，通过“眼见为实”，取得第一手审计资料作为审计证据，来证实审计事项，是工程审计中最常用的方法之一，也是审计过程中很重要的一个环节，因为工程量的落实需要到现场去观察，丈量、测算，然后再与工程结算书比较，从而发现有无虚列工程量的问题。
4、计算法 是审计人员对工程项目中的各项数据进行验算或者另行计算。审计人员的目的在于验证被审计单位的计算结果的正确性；验证被审计单位提供的决算资料的正确性。当计算结果与被审计单位的记录不一致时，审计人员一般应再次验证计算过程。必要时，与被审计单位有关部门和人员进行沟通，沟通不一致时，应以审计人员的计算结果为准。
5、追踪法 就是按照资金的流程实施审计，通过对资金流转的各个环节的追踪，检查是否存在资金流转过程中的“跑、冒、滴、漏”问题，确保建设资金合法、有效的使用。追踪资金流向审计法在审计实践中具有明显的审计效果，资金流转的每一个环节都在审计人员的可控制范围之内，在具体的审计业务中审计人员采取抽样的方式确定样本，完成样本审计的流程过程以期获取舞弊存在的证据，从而决定是否放弃或扩大审计样本。
6、评价法 是指通过审计客体所从事的经济活动行为，利用数学计量或数理统计原理，在内部控制制度相对完善的状态下，有针对的制定出量化的评价标准或体系，科学、合理、细致的计算出经济评价的各项指标，考虑资金的经济效益与社会效益，反映经济的节约与效率效益和对社会的贡献程度。它是目前审计方法中运用起来比较难的一种方法。由于不同行业部门所赋予的经济管理职能不同具体的评价指标存在着巨大的差异性，进行效益评价审计时对于具体的审计项目只能具体问题具体分析。
（四）工程项目经济效益审计评价指标及标准
1、工程项目经济效益审计评价指标
工程项目前期主要是定性评价，主要评价调研程序的合规性；论证的科学性、严密性；费用的节约性；以及有无决策失误问题等等。
工程建设、运营期阶段侧重于定量评价。工程建设阶段使用的评价指标有：投资完成额、投资节约额、资金平均占用、建设工期、质量合格率、事故率、损失率、结算审减率等等。运营期评价指标有：产品市场占有率、成本利润率、销售利润率、投资利润率、投资回收期等。
2、工程项目经济效益审计效益评价标准
工程项目经济效益好的标准简言之就是：质量好、工期短、投资省、造价低、见效快。
（1）质量好 工程质量好的基本要求是：第一、坚固耐用，安全可靠；第二、保证使用功能；第三、建筑物造型、布置以及室内外装饰，要美观、协调、大方。
（2）工期短 工期是否长短的分析主要依据是工程合同和施工总(综合)进度计划，要根据工程合同规定的工期与实际施工进度进行比较。