资金管理的指导原则应当是根据市场的需要和企业的趋势，合理优化配置企业有限的资源，既满足企业正常经营的需要，又节约使用资金，加速周转，提高资源的效率。证券公司的资金管理也是如此。本文拟就证券公司资金管理的内容分别加以叙述。
一、资金运用
第一，证券公司筹集资金后，首先要在交易所保留一定的交易保证金，上交所是上一个交易季度末的交易量的10%，深交所是上一个交易季度末的交易量的20%.第二，证券公司为了正常的运转，还要保留一定的清算备付金。根据多年来的运转情况，这个比例定为上一个交易季度末的10%是比较合适的。
第三，进行大量的固定资产投资，证券公司的固定资产以营业网点和设备居多，其电子设备数量大、品种多、更新换代速度快，必须有充足的资金才能满足经营的需要。
第四，用于自营业务。证券公司的自营业务是指证券公司用自己的名义和资金进行证券的买进和卖出，以获取证券买卖差价为目的的证券业务。一般来说，资金规模应视证券公司自营业务的规模大小，按照国家有关规定来设置。资金规模大，具有抗风险能力强，自营业务规模大，头寸调度方便，盈利规模也可能增大等优点。但若其中的自有资金达不到规定的比例，则：一是有违规风险；二是在证券价格下跌时，很容易吞没本金，造成巨大亏损。因此，对于证券公司自营业务的资金管理主要是运用预测、制定经营战略、制定计划、实施与调节、成果跟踪、信息反馈等管理工具，使资金达到最适规模，以实现证券公司自营的投资战略，在确保安全的前提下，获取尽可能大的资金利润率。
第五，承销。承销是指具有证券承销业务资格的证券公司接受证券发行人的委托，在规定或约定的时间范围内，利用自己的良好信誉和销售渠道将拟发行证券发售出去，并因此收取一定比例承销费用的一系列活动。由于我国的股票发行项目都实行承销商余额包销制，包销条件由承销协议具体约定。在这种承销条件下，主承销商所承担的风险实质上是对未售出的股票依据承销协议承担全部购买的责任。由于我国新股发行仍然供不应求，新股发售风险还没有暴露出来。
第六，项目融资。这是指证券公司在承销某股票时对该企业的某一个项目进行技术性、商业性和经济效益方面的可行性论证后，根据预测的收入、项目的需要、投资者的需求条件及风险等因素，设计出适用于该项目的融资方案，并依靠未来的项目资产和现金流量予以偿还。在管理上，项目融资涉及到一个新的独立的经济（法定）实体，并且据认为这个实体的技术性、商业性和经济效益等方面都是可行的。债务的偿还要尽可能与项目计划的现金流量相一致，而且以项目资产作为担保。如有必要，要由购方、供方或其他第三方来加强保证。融资方案（计划）的构成复杂，且法律文件繁多。在考虑各种因素的情况下，为保证项目融资的顺利进行，要达成一个严格的而又有保障的协议。对项目的可行性进行细致评估，特别强调现金流量、足够的债务保证金及所有成本的可靠性和一致性，这种估价的目的在于证实项目的风险性。但由于市场变化、政策变化等原因造成股票发行项目比预期的时间推迟，从而使发行人无法及时偿还项目融资款；或者发行人募集资金量比预期的少，无法全额偿还项目融资款；更有甚者，股票发行计划被否决，发行人没有其他的资金来源偿还项目融资款，都会造成承销商的资金被占用。
由于我国证券公司目前的融资渠道非常有限，资金来源期限短、成本高，难以长期占用，上述资金被占用，造成证券公司的资产难以变现或在损失较大的情况下变现，将使证券公司面临流动性风险。