3.2 推行责任成本管理
生存、、获利是企业管理的目标，获取财富最大化是企业财务管理的目标。因此，利润是考核企业业绩的重要指标。增加盈利除扩大收入外，首先应全面推行责任成本管理，建立严格的成本开支范围及费用审批制度，将成本开支总额层层分解到最小工作单位和个人，实行全方位成本管理，利润考核与个人收入挂钩。
3.3 加强内部审计监督
采取各种行之有效的措施和手段，加强财务审计监督，目的是确保各项规章制度的贯彻落实。对检查出的严格按制度处理，给国家和单位造成重大经济损失的调整工作岗位，并给予行政党纪处分，构成犯罪的要依法追究刑事责任，以防止国有资产流失，确保国有资产保值增值。
4、加强培训提高财务人员素质
铁路科研单位转企后，会计人员要对每笔支出与收入进行配比，对生产成本进行归集、分配，对各项费用进行结转、摊销，要对企业未来的产品取向、投资决策提供全面准确的信息，工作具体细致，技术含量高，要求会计人员必须不断和提高业务水平，逐渐从单纯的计账、算账型会计向管理型会计转变。
总之，铁路科研转制企业的财务管理必须符合科学技术发展，按市场经济规律办事，才能最终实现科技与经济的一体化融合。