我国会计电算化的迅猛发展和普及，使会计工作发生了重大变化，会计电算化的开展，减轻了财会人员的工作强度，提高了会计工作效率和工作质量，促进了会计工作的规范化，为管理工作的现代化奠定了基础。
会计电算化的特点决定了原来手工会计核算方式下的内部控制制度大部分将失去作用，因此必须重新设计内部控制环节，建立科学严密的会计电算化内部控制制度，以保证会计数据的安全和保密。应从下列四方面着手健全科学的会计电算化内部控制制度：
1.组织控制。数据处理部门内部人员要有明确的岗位和职责分工，应设置系统数据管理员、系统维护员、操作员和审核记账员等岗位，各岗位都得到一定的授权，并用密码加以控制，防止非法操作和越权操作。
2.操作控制。严格按照会计业务和处理流程进行操作，在会计软件中设计防止重复操作、遗漏操作和误操作的控制程序，违反操作规程和操作时间应及时予以提示和制止；建立操作日志制度。计算机程序中应对所有操作留有记录，包括操作时间、操作人姓名、操作内容等。对已记账和已结账业务设置不可修改或逆操作程序，要修改必须通过编制记账凭证冲正或补充登记来更正。
3.数据输出控制。会计资料是单位的机密，一旦泄漏将给单位带来不应有的损失，而磁性介质的可复制性又使会计资料极易泄漏而不易发现，故会计电算化系统的输出不论是磁性文件还是打印资料，输出后均应立即受到严格管理，以防被人窃取或篡改。磁性资料应由会计档案保管员负责保管；打印资料在系统的操作日志上有所记录后(包括记录输出时间、文件页数及操作人员姓名)及时送达指定人手中；收件人要签收并注明收件日期、文件内容，以便日后备查；确保会计数据和会计软件的安全保密，防止对数据和软件的非法修改和删除，对磁性介质存放的数据要保存双备份。
4.硬件与软件系统的开发与维护控制。包括需求分析、系统的设计和测试、系统的运行与维护以及系统文档资料的保管等，即对正在使用的会计核算软件进行修改、升级和硬件设备的更换，要有一定的审批手续，要保证会计数据的连续和安全，并由有关人员监督实施。要保证机房设备的安全和计算机的正常运行，健全排除硬件与软件系统故障的管理措施，保证会计数据的完整性，健全必要的防治计算机病毒的措施。中国财经报·罗公明（完，空心雨论文网）