第二，做好内部会计控制制度的分析评价工作，以便发现企业内部会计控制制度的弱点与缺陷，提出合理化的建议，为建立健全内部会计控制提供依据。
对内部会计控制制度的分析与评价应该从两方面着手：一是从内部会计控制的具体构成要素与存在的薄弱环节上分为：①包括控制环境、风险评估、控制活动、信息与沟通、内部监控等构成要素的评价；②对可能发生差错、舞弊等违规行为的薄弱控制环节的评价；二是根据内部会计控制制度执行情况，主要包括：①合理性评价；②健全性的评价；③有效性的评价。
在对内部会计控制制度进行调查测试、分析评价过程中，内部审计人员应对所发现的内控制度的缺陷进行记录、归类、汇总，并说明制度的缺陷可能产生的弊端以及对内控制度的影响。内部审计人员在对制度进行全面深刻的认识了解后，便可以进行恰当的分析评价，一般有三种不同类别的评价结果：可信赖度较高、可信赖度一般、可信赖度较低。内部审计人员可以针对不同的评估结果，提出切实可行的建议与措施，帮助本单位建立健全内部会计控制制度，提高经济效益。
第三，实行审计监控模式转变，充分发挥内部审计在企业内部会计控制制度执行中的监控作用，督促各项内控制度的落实，防止减少差错舞弊等现象，提高经济效益。
企业内部审计对内部会计控制制度的监督控制内容，一般是根据企业生产经营活动的业务环节、会计核算的内容来分类的，主要包括：销售与收款环节的内部审计控制、购买与付款环节的内部审计控制，成本费用的内部审计控制、实物资产的内部审计控制、货币资金的内部审计控制、筹资与投资的内部审计控制等。
由于企业内部审计具有监督经常性与过程控制性的特点，并且强调对经济活动的事前监督与过程控制。因此，能有效地将某些差错舞弊等违规行为消灭在萌芽状态。内部审计在某种程序上可理解为对内部控制的控制。在强化内部监控、加强内部审计制度建设、充分发挥内部审计监督作用时：一是要求企业结合自己的实际情况，制定出包括监督原则、监督内容、监督方式、监督责任与监督奖惩等内容的内部监督办法，达到凡事有章可循、凡事有据可查，使企业内部监督规范化、系统化、制度化；二是狠抓落实，严格照章办事，使企业内部控制与内部监督达到事事有人负责，事事有人监督的要求；三是拓宽内部审计监控范围，加强内部审计职能，尽量覆盖所有的经营活动领域，除着眼企业经营管理活动的合法性、合规性、真实性以外，还应兼顾效益性；在对重要的业务与岗位进行经常性的监督检查的同时，加强对企业重点、难点、热点问题的专项检查与审计；实现从以突出为主的内部审计监督方式，向常规性内部审计为主、以必要的定期与不定期突击性内部审计为辅的审计监控模式的转变。
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