一、增值税应遵循的基本原则
从理论上来说，一个完善的增值税制度应构建在以下基本原则基础之上：
1.税收中性。任何一种税收制度的设计，从总的方面来说需考虑两方面的因素一公平与效率，并力求在两者之间达到一个最佳均衡点（以一定的社会福利函数为约束）。具体到每一税种来说，其侧重点又各不相同，间接税侧重于效率，直接税更关注公平因素。按税收的归类原则增值税属于间接税类，因此效率是增值税设计时应予以充分重视的因素。税收的效率主要涉及两方面，一是税收对资源配置效率的影响即经济效率二是税务行政的效率。中性原则指的主要是税收的经济效率。在盎格鲁一萨克逊传统下，市场被认为可以自发地有效运行，税收的中性要求税收不要干预资源的配置，以免扭曲当事人的经济行为。但现实却是任何一种税都会对当事人的行为产生影响，除非政府不征税，而这几乎是不可能的。因此现代税收理论更为适合的税收中性原则是指在承认税收会引起效率损失的前提下为取得一定收入谋求效率损失的最小化。税收的非中性缘于税收改变了商品与商品、劳务与劳务、商品及劳务之间的相对价格体系即产生了替代效应，破坏了帕累托最优的一系列边际条件，也改变了相关利益主体的生产、投资、消费函数和决策。要减少税收替代效应带来的效率损失要求对所有的课税主体和客体一视同仁，不能因为地区、行业、产业、产品等不同而给予不同的税收待遇。
2.便于管理和征收。该原则是说好的税制必须与政府的税务行政能力相适应；必须有利于降低税务机关的管理成本和纳税人的奉行成本。一种税制无论在理论上是多么的最优，但如不具备可操作的现实基础条件，超过了税务机关的行政能力和纳税人的纳税综合素质，那么该税制就没有什么实用价值。例如税务机关不能要求一个在街边卖茶叶蛋的老太太建立、保存完整的税务会计资料，以准确地确定其应税所得。
3.稳定取得收入和充分弹性。从目前各国的税务实践来看，税制结构的发展趋势是一种现代直接税和间接税并重的双重税制结构，增值税以其优良的中性特性在各国的税制结构中（除美、日等少数国家）具有重要的地位，通过增值税取得的财政收入占一国政府收入总额的比例是相当高的，在我国甚至达30％以上。及时、稳定地取得税收收入并能根据经济的发展自动按一定速度增加对于实现我国政府职能具有重大的意义，这也是提高两个比重和振兴财政的根本要求。完善的增值税在多环节广泛征收，以经济活动的增值额为征税依据，与经济增长的正相关程度相当高。
4.有利于促进经济增长。经济的增长包括量的和质的增长两方面，是诸多因素合力作用的结果，其中投资水平与产业结构适时调整的作用尤为明显。就经济与税收的关系来说，属于经济基础和上层建筑的范畴，经济发展水平决定税收，税收服务于经济建设。增值税的设计也应从如何配合国家的产业政策、经济发展计划，发挥税收利益杠杆的调节功能以引导企业的行为方式促进经济的持续、快速发展的角度加以考虑。
5.公平与国际惯例。市场经济的基本原则就是公平竞争，税收是企业竞争的制度环境重要组成部分，尽力做到对不同经济性质、不同产业、不同地区的企业给予公平税收待遇是建立完善的社会主义市场经济体系的内在要求。与此同时，随着我国加入WTO，作为世界经济的联合国WTO制定了一系列旨在促进贸易自由化、知识产权保护、反倾销等方面的规则，成为其成员国就意味着权利的享有和义务的承当。在增值税方面来说，就存在一个向世贸规则靠拢并遵循国民待遇、非歧视等原则的问题，以尽量减少与他国的贸易纠纷和增进对外开放水平。