运作机制僵化，缺乏灵活性。作为最后贷款人，基金组织应当在成员国发生危机时起到提供流动性、恢复市场信心的作用。但是，基金组织在几次金融危机中的援助反而由于苛刻的附加条件起到了恶化危机的作用。东南亚金融危机中，虽然亚洲各国危机的成因和表现不尽一致，但是IMF所开的“药方”却是千篇一律。从实际情况看，IMF这些条件进一步加剧了金融市场的动荡，产生了适得其反的效果。
资金实力不足。作为最后贷款人，基金组织应当具备充足的流动性，但IMF目前的资金状况却令人堪忧。例如，IMF于1997年8月11日对泰国实施了第一次援助，涉及金额160亿美元，IMF仅承担其中的40亿，其余部分由其他国际组织和美国、日本承担，因而延缓了援助的时效。
3.1.2 亚洲货币基金（AMF）的设想
作为区域性金融市场的研究中心，AMF应发挥以下几个方面功能：第一，对各成员国进行常规性监测，提出分析报告以及金融监管和政策方面的意见和建议；第二，研究制定成员国金融监管、信息披露等方面的行为标准和规则，加强各成员国金融监管当局之间的交流与合作，建立相关技术援助与培训制度，提高各成员国在金融运作方面的透明度和监管有效性；第三，建立融资机制，分散和化解区域金融风险。通过集中成员国的部分外汇储备以及从国际市场上筹集资金，向国际收支出现困难的成员国提供短期融资支持，以稳定金融市场；第四，发挥最后贷款人作用。对陷入金融危机和经济困难的成员国提供及时的紧急援助，以稳定金融局势，防止区域性金融危机和经济动荡。
3.2 关于亚洲单一货币区中核心货币的选择问题
一种货币要为区域内各国所接受，首先汇率要稳定，这是重要的先决条件。其次，经济发展应较为稳定，开放程度较高，这是一国货币能否实现国际化的基础。此外，政府要拥有充足的黄金外汇储备，以及从国外融资的能力，以应付随时可能发生的汇兑要求。目前，较为可能的是以日元或人民币作为核心货币，建立单一货币区。
3.2.1 以日元为核心建立亚洲单一货币区
日本的经济规模居全球第二，其通胀率一直维持在较低水平，日元也是区域内最国际化的货币。近年来，日本与东亚各国的经济关系越来越密切，在某些国家其重要性已经超过了美国。但从目前东亚地区的发展状况来看，“日元圈”的形成乃至日元国际化的推广将面临着一系列问题。
第一，日元汇率波动频繁。一种货币要被人们接受，成为国际区域的硬通货，汇率的“稳定”是重要的先决条件。但1995年以来，日元的汇率便开始一泻千丈，短短不到三年的时间里竟贬值了近100%。以后，日元便开始了一段剧烈的动荡期，从1998年8月到1999年5月日元对美元汇率的最高值超过了最低值的25.9%。
第二，日本金融机构不良债权恶化。日本金融机构的不良债权在２０世纪90年代初经济泡沫破灭之后，就已经大量出现，但一直被遮掩起来。１９97年亚洲金融危机之后，不良债权进一步恶化，一些银行证券公司相继倒闭或被兼并，金融体系无法正常运转。如果日本金融机构不良债权问题不能及时解决，破产、倒闭风盛行，必将造成日本金融业的瘫痪，影响到东京的国际金融中心地位，进而影响到日元的稳定，日元国际化更无从谈起。
第三，日本在政治上和外交上的局限性，将在很大程度上影响日元的国际化进程。亚洲国家难以忘却日本推行“大东亚共荣圈”给亚洲人民带来的苦难，对日本在亚洲扮演“领袖”角色十分反感。此外，美国的作用也是影响日元国际化进程的重要因素。因此，日元的国际化面临着经济和政治的双重障碍。
3.2.2 人民币的国际化问题
中国是亚洲地区经济增长最快的国家之一，其整体经济规模和巨大的国内市场使中国在东亚乃至全世界都有相当的影响力和发言权。结合货币国际化的基本条件，不难看出人民币的国际化是有现实基础的。
第一，综合国力明显提高，对外开放程度也有了显著的飞跃。加入WTO以后，我国的开放程度还会加大，经济、金融全方位开放将直接推动人民币在区域内、以至国际上的广泛使用。