对待改制国有企业拥有的土地使用权的处置问题，因其使用权来源的不同而存在不同的解决途径和办法。
一、 若土地使用权来源已属出让方式，则在改制过程中并不涉及土地处置问题，仅需根据该地块的客观区域因素和个别因素采用合适的评估方法进行评估，土地评估方法主要有市场比较法、收益现值法、成本逼近法、假设开发法、路线价法和基准地价修正法，如前所述，在企业改制评估中，对基准地价修正法应慎用，以避免国有资产流失。对这类土地使用权进行评估时，切忌直接采用政府公布的出让金标准作为评估值，因为出让金不是地价，况且政府公布的出让金只是出让金下限，而随着我国新的土地政策的出台和实施，协议地价将逐渐被取消，而代之以拍卖地价或招标地价，这些新政策的精神从另外一个侧面印证着在国有企业改制中，不得以政府公布的出让金标准作为土地使用权的评估值。那么反过来，在国有企业改制中，土地使用权的价值确定是否应以拍卖价或招标价作为评估值呢，并不是的，因为拍卖价或招标价从其内涵上看并非为公允市价，而可能带有个别特征或受着特殊的购买因素的影响，个别特征的存在或特殊购买因素的影响往往使得拍卖成交价或招标成交价较公允市价偏高或偏低。因此，在对这类土地使用权进行评估时，应准确定位土地使用权的价值定义，即为公开市场价值（或称公允市价），并正确理解这一价值定义的内涵，并选择与这一价值定义相吻合的评估方法。在实际工作中，有些评估机构和评估人员将土地使用权账面摊余价值作为评估值，这是非常错误的，因为：账面原始价值往往不能完整反映土地使用权价值，有些账面值仅反映国有企业补缴的土地出让金，而将原土地拆迁安置费用或征用费用直接在当期进行了列支、并未作资本化处理，即便这些费用都进行了资本化处理，如前所述，这些费用加上国有企业后期补缴的出让金也并非为土地使用权的完整价值，另外，账面土地使用权的摊销方法与土地使用权评估中的土地期限修正方法，不管从方法内涵上还是所带来的结果上看，都存在很大的差异，绝不能混为一谈。
二、土地处置问题存在于待改制国有企业原有土地使用权来源属划拨方式之情形。
对划拨土地使用权的处置方式，根据《国有企业改革中划拨土地使用权管理暂行规定》第三条规定：“对国有企业改革中涉及的划拨土地使用权，根据企业改革的不同形式和具体情况，可分别采取国有土地使用权出让、国有土地租赁、国家以土地使用权作价出资（入股）和保留划拨用地方式予以处置”。而在这四种处置方式下，评估时所采用的方式及途径也不尽相同，具体叙述如下：
（1）、对采取保留划拨用地方式进行处置的，无需对原账面划拨土地使用权的价格进行具体的评定估算，但为了合理体现改制前国有企业的资产范围，仍需对划拨土地使用权原账面金额按现行会计制度和会计准则进行核实，并以核实后的金额作为评估值列示，纳入改制资产范围。对原账面尚未将取得划拨土地使用权过程当中所支付的拆迁补偿安置费用或征用费用作资本化处理的，应相应调增原账面土地使用权价值。对原账面土地使用权价值为上世纪九十年代中期清产核资调整的价值的，应根据核实后的金额作为评估值。
（2）、对采取国有土地租赁方式进行处置的，因在这种处置方式下，该划拨土地使用权实际并未纳入改制资产范围，也即尚未纳入评估范围，因此就不涉及对划拨土地使用权进行评估这一问题。在具体操作过程中，应首先将国有企业原账面存在的划拨土地使用权价值进行剥离，然后另行对国有土地使用的租金水平进行评估，并将该租金水平评估结果一并运用于改制方案当中，以规范国有土地租赁行为，并防止国有资产的流失。
（3）、对采取国有土地使用权出让方式进行处置的，对土地使用权进行评估时，又存在两种程序和途径：① 将该国有土地使用权纳入改制资产范围，也即纳入评估范围。在这种情况下：