3、资本金投入
国家以资本金投入方式对科技型中小企业进行补助，主要目的在于引导其他资本的投入，数额一般不超过企业注册资本的20％，原则上可以依法转让，或者采取合作经营的方式在规定期限内依法收回投资。
若国家以投入资本金的方式进行补助，则不是“政府补助准则”规定的事项，不按照该准则处理，而按照一般投资准则处理，企业在收到资本金投入时，计入“实收资本”。
三、不同的会计处理方法对经济指标评审结果的影响
创新基金项目合同签订的经济指标，往往包括执行期企业的资产总额、销售收入、税收、净利润、创汇等，项目验收评审，根据的是企业实际完成的经济指标与合同指标进行对比与评价，而企业实际完成的经济指标又根据会计师事务所的专项审计报告认定，如果专项审计报告对企业关于创新基金的不同会计处理方法没有统一的口径，而是就企业提供的数据确认，则对评审结果将产生很大的影响，这种评审结果是不准确的，对企业也是不公平的。
采用何种账务处理方法是正确的，首先应明确创新基金是否计入企业的应完成的经济指标，含资产总额、销售收入、净利润、税收指标等。创新基金的目的在于扶持和引导科技型中小企业技术创新活动，促进科技成果的转化，因此，对项目执行结果评价的经济指标应该是该基金投入使用后产生的实际结果，应该按照国家统一会计准则的规定进行账务处理的结果评定，创新基金计入补贴收入而不计入销售收入，影响企业净利润及所得税指标，同时影响资产总额指标，但不影响流转税与创汇指标。
以下对此问题举例说明：
例：某科技型小企业原有资产总额为100万元，负债50万元，所有者权益50万元，A项目得到科技创新基金40万元，其中，用于购置固定资产15万元（使用年限5年），用于研发费用25万元，企业自有资金投入研发费用30万元。项目执行期应达到的经济指标为：资产总额150万元，销售收入50万元，税收7万元，净利润10万元。该项目执行期的实际销售收入为35万元，税收6万元。
则按照不同的会计处理方法对资产与净利润的确认结果不一样：
1、按照新准则（16号）确认与计量的结果：
科技创新基金40万元的投入，形成固定资产15万元，折旧3万，则固定资产净额12万元，专项应付款12万元，补贴收入28万元，管理费用28万元（研发费用25万元，折旧3万元）。
项目运行结果：
企业增加资产17万元〔固定资产净值12万；货币资金5万元〕，增加负债12万元（专项应付款余额），净利润为5万元（35＋28－55－3，不考虑所得税因素），即增加净资产5万元。验收时，企业资产总额为117万元，完成合同78％；销售收入35万元，完成合同70％；净利润5万元，完成合同50％；税收6万元，完成合同86％；负债62万元，净资产55万元。
这种核算结果真实反映企业销售收入及补贴收入，反映实际研发费用的支出，而政府补助部分则作为投入研发费用及新增折旧部分的弥补，增加企业的净利润。
2、几种不同的会计处理方法及其结果（设销售收入35万元，税收6万元不变）：
（1）如果将固定资产购置也计入研发费用，而将研发费用40万元在发生时即直接冲减专项应付款－创新基金，则结果是净利润为20万元〔35-（55－40）〕，完成合同200％；资产为120万元，完成合同80％；负债50万元，净资产70万元。
（2）如果将创新基金40万元直接计入当期收入（补贴收入），则企业净利润为20万元（35 40-55），完成合同200％；资产为120万元，完成合同80％；负债为50万元，净资产为70万元（与（1）结果一样）。
（3）如果将15万元购置仪器设备计入固定资产，提折旧3万元，将该部分创新基金15万元转入资本公积，而将研发费用25万元在发生时即直接冲减专项应付款－创新基金，则结果是净利润为2万元〔35-（55－25）－3〕，完成合同20％；资产为114万元，完成合同76％，负债为50万元，净资产为64万元。