搞好事业单位支出管理改革还应认真理顺好以下三个关系：
一、“放”与“管”的关系。所谓“放”，首先是在思想上要解放，要敢于大胆去试，大胆去闯，政府对事业单位要从直接微观的管理转到间接宏观的调控上来，从过去管人、管物、管事转变到政策引导和业务的指导上来；其次要清理与改革相悖的政策与规章制度，打破一切制约改革发展的条条框框，陈规旧习，创出一套有利于事业发展的好办法，通过制定宽松的鼓励政策，建立、完善合理的制度，保证改革的顺利运行；再次，要努力营造一个有利于改革发展的外部环境，让社会各界都来支持事业单位支出改革，使财政及有关部门能放开手脚地探索改革发展的新路子。在立足“放”的同时，为确保事业单位支出改革稳步发展，更应该重视一个“管”字，防止事业单位进入市场后可能出现的无序竞争及其它不正当行为。讲“管”要抓住三个方面。一是加强对事业单位布局设置的管理，避免事业单位网点布局重复设置的问题。市场经济是按价值规律来调节资源配置的，当一种行业能获取较好价格时，便会有众多的主体竞相参与。如有的小县城，仅几万人却出现几十所私立幼儿园和私立医院，其结果必然因服务对象的不饱和而出现一种非良性竞争态势。所以必须通过把好审批办证关，使事业单位网点布局趋于合理，从宏观调控上营造一个有序竞争的市场格局；二是加强收费及价格的管理，市场经济条件下，经营主体在竞争中，为争取服务对象可能采取非正常的低价位收费，或者与此相反，当其处于垄断地位时，受利益的驱动，也可能出现违反价格法的高价位收费，因此，政府有关部门必须通过加强管理使收费与价格既合理又合法。三是加强事业单位服务质量的管理。社会主义国家的性质，决定了事业单位必须坚持全心全意为人民服务的宗旨，所以，政府应通过必要的监督检查与督促考核办法，使走向社会的事业单位始终把社会效益摆在第一位，对于执业水平太低，只为求经济效益而损害消费者利益的行为要坚决制止。对于教学质量太差，误人子弟的私立学校，要限期整顿甚至对其关、停、并转，对不符合基本医疗卫生条件的私立医院要坚决取缔。
二、“推”与“保”的关系。把事业单位推向市场，这是市场经济发展的必然趋势。按照市场优先的原则，凡是能由市场调节的领域，都应全面推向市场，由市场来配置资源结构，从而有利于解决财政“越位”与“缺位”的问题。把事业单位推向市场是减轻财政负担的极好办法，但“推”的目的，并非简单的为了“甩包袱”，在“推”的同时，我们还应讲求一个“保”字，即做到“推”中有“保”，“保”中有“推”。
在“推”方面，一是要明确被推的对象，明确事业单位支出改革并非将所有的事业单位推向市场，而是将那些可以参与经营竞争、可由市场调节其发展的事业单位推向市场，对于那种纯公益性的事业单位，市场调节不灵的领域，财政必须千方百计予以确保；二是对于那些半公益性的事业单位，财政可通过核定支出范围，将其盈利性的一部分推向市场，非盈利性的一部分仍由财政保障供给；三是对于那些非公益性事业，如应用科研、艺术、中介服务的事业单位，政府不应再提供经费。但是将其全面推向市场实行“断奶”时，也不能一“断”了之，而应在促进其创造生存条件的基础上，在三年内逐步实行“断奶”，使之有个适应发展的过程，对个别特殊情况，如市场条件尚不成熟的，可以分步取消其财政补贴，并对其给予暂时的经费保障，做到“推”中有“保”。
在“保”方面，要坚持一个基本原则，即纯公益性的事业单位，对其经费供给在强调确保的同时，也应做到“保”中有“推”。如义务性教育，在许多人眼中，似乎是财政支出改革的禁区，谁也不敢越雷池一步，否则就可能被戴上违反义务教育法的大帽子，其实这是教条主义观念作祟。从道理上说，国家财政对义务性教育本应想方设法予以保证，但笔者认为，在财政困难的情况下，也不应为了条条框框自捆手脚，而应采取积极的态度，鼓励社会兴资办学，适当将部分义务教育引入市场机制，让私人、外资、一切社会力量通过多种形式与政府共同解决穷国办大教育的问题。赣州市、瑞金、寻乌等地私人办学的成功经验充分表明，那种“不要国家一分钱，红红火火办教育”的办法，确实是市场经济条件下，发展教育的一条好路子，它不但能减轻财政教育经费的沉重负担，同时也能有效地运用市场竞争机制提高教学质量，促进教育事业的良性发展。另外，对必保的公益性事业单位，并非所有经费都要列入公共财政支出范畴，如对义务制学校的后勤事务，除对家庭生活非常困难学生的住宿，仍由财政支出予以保障外，也可全面推向市场。瑞金市近期将全市34所中学后勤工作引入市场，采取限额承包与租赁等方式，对暂无资金兴建而又急需兴建的学生宿舍，吸纳民间投资兴建，并根据学生的条件以偏低的价格经营，从而使学生住宿条件大为改善。目前，瑞金一批由社会投资的公寓式学生宿舍正在兴起，这一办法有效地减轻了财政负担，仅1999年就减少了财政为教育后勤支出507万元，确实是“保”中有“推”的明智之举。