2．完善现行法律，补充有关针对电子商务的税收条款。考虑到我国仍属于发展中国家，是先进技术的纯进口国，为维护国家利益，在制定相关政策法规时，应坚持居民管辖权与地域管辖权并重的原则。尽管从短期来看，无须对电子商务征收新税，但从长远来看，必须研究制定相关的税收法规，明确网络交易的性质、计税依据、征税对象等，在我国现行增值税、消费税、所得税、关税等条例中应补充对电子商务征税的相关条款。
3．建立专门的电子商务税务登记制度。实行电子商务后，企业形态将发生很大变化，出现虚拟的网上企业，因此，必须要求所有上网单位都向税务机关申报网址、电子邮箱号码等上网资料，公司的税务登记号码必须展示在其网站上。实施税务稽查时，稽查人员可以通过查询企业网站，来获取企业的信息是否与申报信息一致，以便及时对企业实行监控。
4．加大税收征管科研投入力度。从硬件、软件和人才上改善监控条件，提高硬件的先进程度和软件的智能程度，大力培养既懂税收业务知识又懂电子网络知识的复合型人才，尤其要提高稽查人员通过操作财务软件查看企业财务报表的水平。建立备案、核算、代扣代缴等税收征管制度，开发自动征税软件等专业软件，利用高科技技术来鉴定网上交易，审计追踪电子商务活动流程，简化纳税登记、申报和纳税程序，对电子商务实行有效税收征管。
5．紧紧围绕银行资金结算这一关键环节展开税务稽查。目前，在我国通过网上银行，还未实现大额、实时、跨国资金结算，电子货币还未推行，电子商务法律不健全，电子票据的法律效力尚未确立。因此，付款手段不可能发生根本变化，通过银行资金帐户往来情况进行税务稽查是当前对付电子商务的重要手段。
6．利用互联网进行纳税申报。税务机关可在互联网上开设主页，将规范的纳税申报表及其附表设置在主页中。纳税人通过计算机登录访问该主页，将需要的纳税申报表等下载到自己的计算机中，输入有关的申报数据后，以电子邮件方式发送到税务机关的电子信箱中，同时签发一封信件寄给税务机关，以确认该项申报的有效性。税务机关在收到确认信后，对电子信件进行安全性检查，然后转入税务机关计算机处理系统中，确认该项申报有效。
7．利用电子商务提高为纳税人服务的质量。电子商务给税收征管带来困难的同时，也提供了机遇，税务机关可以通过电子商务更好地为纳税人服务。税务机关与纳税人间的联络可以通过网站进行，如税务机关可以通过网络发布税务信息、处理电子邮件、接受电子申报、建立自动退税系统，等等。这方面可以借鉴美国等发达国家的做法。美国国内收入局在互联网上设立了专门的税收站点，免费提供税收资料、接受电子申报。美国还提出“电子税务管理”方案，以便更高效地为纳税人服务。
8．在税收征管和稽查过程中加强国际情报交流和合作。由于电子商务是全球化、网络化、开放化的贸易方式，其高流动性、隐匿性削弱了税务系统获取交易信息的能力，更会引发诸多国际税收问题。单独一国税务当局很难全面掌握跨国纳税人的情况。这对各国的税收协调提出了更高的要求，只有通过各国税务机关的密切合作，收集纳税人来自世界各国的信息情报，才能掌握他们分布在世界各国的站点，特别是开设在避税地的站点，以防上网企业偷逃税款。这些都离不开国际税收协定的配合和支持。