经济责任审计制度是保障企业国有资产保值增值，加强廉政建设，预防违法违规行为发生的重要措施。1999年5月，中办、国办印发了《国有企业及国有控股企业领导人员任期经济责任审计暂行规定》，此前，铁道部发布了《铁路企业厂长任期经济责任审计实施办法》，这两个文件，是铁路企业开展经济责任审计的法规依据。铁路企业为适应自身改革与发展的需要，将把经济责任审计作为日常审计工作的重要项目。正如国家审计署李金华审计长所指出的：“经济责任审计成为领导干部监督管理机制和党风廉政建设的重要内容，进入了一个新的发展阶段。”
1、铁路企业经济责任审计的内容
铁路企业经济责任审计工作量大、范围广、内容复杂，涉及铁路企业的财务状况和经营结果的真实性、经营指标完成情况、内部控制制度的健全和有效性、财经法纪遵守情况，以及经济效益情况等多方面。但以下几项是在铁路企业审计过程中需要特别关注的问题。
（1）资产账实不符。如：更新改造支出形成的固定资产，长期挂账不验收转列固定资产；更新改造工程虚假验工计价；债权不及时清理，造成大量呆账、坏账。
（2）运输成本费用支出审计。运输成本费用审计要避免太“琐碎”，要着眼于成本结构优化、成本（资金）投入与运输生产任务相匹配。由于固定资产投资计划管理体制的原因，有的单位追求过多的设备，从而增加了设备使用的成本负担；有的单位以大修代替维修，或以加强维修代替大修，影响了资金的正确使用和设备的正常使用；有的单位通过多经、集经承包和层层转包本应由运输主业完成的大修、维修项目，甚至承包给外单位、个体户。这些做法，都直接增加了企业的成本费用负担，影响了企业的经济效益。
（3）工资管理问题。如：违反规定提列工资，不通过“应付工资”科目发放工资和发放不统计。
（4）内部控制制度的健全和有效性。一个企业内部控制制度不健全或形同虚设，企业的生产经营和财务收支活动是难以有序进行的。对内部控制制度进行防护性审计，是加强铁路企业经营管理，提高经济效益的有效途径。
（5）联系生产实际，发现经济效益增长亮点，帮助企业提高经济效益。审计人员要下功夫熟悉、研究铁路企业生产业务流程。铁路企业的经济效益增长点是很多的。如：机车车辆单位开拓机车车辆简易厂修（段做大修）能力；供电单位降低机车牵引供电、企业供电电损率；供水单位保证生产生活用水收费完整；供热单位保证生产生活集中供热收费完整；物资供应单位降低物资采购成本；运营单位压缩汽车运用维修费用和电话费用；车务单位客货运输收入的堵漏保收等，都是企业的经济效益增长点。
2、铁路企业经济责任审计的完善
目前铁路企业经济责任审计存在着传统的“财检 评议”模式的缺陷。如果不摒弃这种审计思路与方法的狭仄，经济责任审计的预期效果就难以发挥出来。2000年6月，国务院发布了《企业财务会计报告条例》，重新修订了会计要素的定义，财政部陆续发布了一系列具体会计准则，会计制度已发生了很大的变化，而审计如还抱着过去的财务收支审计的旧观念、旧做法，就适应不了会计工作的发展和企业经营管理需要。
搞好经济责任审计，要把经常性财务收支审计与经济责任审计结合起来，经济责任审计要以企业资产负债损益的真实性审计为基础。为了完善铁路企业经济责任审计，提出以下几点看法和建议。
（1）严格履行审计程度。严格履行审计程序是落实审计内容的有力保证，只有全面履行审计程序，才能完成计划的审计项目内容。为此，需要制定周密的审计方案，保证必需的外勤工作时间。