一、GATT/WTO体系下贸易与环境的冲突
（一）环境保护与非歧视原则的矛盾
非歧视原则是WTO中的最基本原则之一，包括最惠国待遇原则和国民待遇原则。最惠国待遇原则要求对缔约国方的相同产品在关税上享受相同的待遇。但有学者认为从环境保护的角度看，对以有害于环境的加工和生产生产出来而最终用途和物理特性相同的产品，是不能实施非歧视待遇的。国民待遇原则关注的是进口产品在国内的税、费及政府管理上的待遇。如环境保护与国内税（环境税），GATT第2条第2款第1项规定，缔约方可以对进口产品征收与相同的国内产品征收的国内税相同的费用。然而，在许多情况下，征收环境税是不合理的，因为消除环境成本差异就等于消除来自贸易上的收益，问题的关键是成本判别是否源于合法的环境要素禀赋比较优势。又比如环境保护与政府管理（环境标准），按照非歧视原则，应对外国实行国民待遇标准，但是在环境保护领域，专家、学者们对这一问题就有不同的观点。这主要表现在环境标准的适用。典型的例子就是跨国公司在发展中国家投资企业应该适用母国的环境标准还是东道国的环境标准 ？从有利于环境的角度看，跨国公司在发展中国家投资企业，不应适用东道国较低的环境标准，应适用母国的环境标准或其他较高的环境标准，但这种观点和WTO的基本原则是有矛盾的。
（二）环境保护与公平贸易原则的矛盾
出口倾销和出口补贴一直被认为是典型的不公平贸易行为。执行严格环境标准的国家欲对来自环境标准较低的国家的产品征收反补贴税或反倾销税。根据《反补贴协议》对“补贴”的界定，相对宽松的环境标准，是不属于“补贴”范畴的。另外，发达国家的厂商认为，由于环境标准不同而造成的产品成本差异使发展中国家享受了不公正的成本优势和竞争优势，使自己处于不利地位，并认为这种低成本的环境标准构成了“生态倾销”。学者们普遍认为对在相对宽松的环境管制条件下生产的产品提起反倾销，是难以为WTO所接受，对发展中国家也是十分不利的。
（三）发展中国家的特殊待遇问题
GATT对发展中国家规定了一定的优惠待遇，但在环境保护领域，发展中国家的产品是否也享受特殊待遇，对此与会的专家、学者们有一些争论：一些学者认为对发展中国家的优惠待遇应以WTO的直接规定为准，而另一些学者认为WTO并非没有类似的规定，比如对环境保护的例外可以有更宽泛的理解。但问题在于，只有发达国家有条件也有能力利用环保例外条款去维护“环保权”。依据环保例外条款，发达国家可以设置较高的产品标准、动植物卫生检疫标准以及补贴标准，这些标准在一定程度上抵消了发展中国家在环境资源等方面的优势，这就在事实上造成了对发展中国家优惠待遇原则的破坏 .
二、发达国家与发展中国家在WTO贸易与环境问题上的主要分歧
与会的专家、学者们就这个问题进行了充分的讨论，归纳起来，有以下几个方面：
（一）环境税。征收环境税、费被缔约方政府用来实现保护环境的目标和内化环境保护成本的要求。《关贸总协定》原则上不反对成员国对进口产品征税。由于发达国家在20世纪70-80年代就开始在国内推行环境税，而且环境税占GDP的比例逐步增加。在这种情况下，发达国家可能对进口产品征收边境调整税，或出于国内企业竞争力的压力，要求发展中国家实施环境税制，这对发展中国家的国际贸易是不利的。
（二）环境标志。为保护环境，发达国家早已实施环境标志制度。而环境标志制度建立不当，可能形成新的国际贸易壁垒。对此已引起各国的关注，特别是发展中国家的关注。因为，环境标志制度所确定的产品的环境标准相当高，发展中国家的厂商很难满足这种要求。为达到环境标志的要求，产品的生产须改变原材料成分及生产工艺，这又受到其发展水平、资源禀赋及技术能力等的制约；另外，产品的检测难度大、环境标志费用高也成了发展中国家的一种额外的负担。