首先，从财务管理的主体来看，民营企业存在着管理者财务观念淡薄，财务工作人员素质不高的问题。
民营企业财务的最大问题在于整体管理水平的落后。在我国的民营企业中，相当一部分管理者文化素质不高，不具备化的经营管理理念。素质相对较高的民营高企业管理者，又普遍存在着长于技术而拙于管理的现象。大部分民营企业主缺乏财务管理的意识，对企业财务管理的认识还停留在“记账”、“算账”上，普遍存在着不依法建账、兼职做账、突击做账、以票代账、白条抵现的现象。这势必会造成企业财务管理的无章、无序和混乱状态，导致暗箱操作盛行，企业信息失真，给财务工作埋下隐患。同时，更为严重的是民营企业的财务主管人员大多也未具备相应的专业素质。由于家族式管理，大部分民营企业由管理者本人的亲属担任、出纳，甚至出现出纳人员领导财务工作现象。这些隐患的危害在创业初期尚不明显，但一旦进入资本化、规模化经营后，它们的力就会逐步扩大，最终将导致企业走向衰退与没落。
其次，从财务管理的客体来看，民营企业的财务活动存在着以下几方面的问题：
（1）筹资活动方面：融资困难，资金严重不足。
民营企业的服务严重滞后。据《产经新闻》2004年9月4日报道，1997年～2002年，我国民营企业自筹资金比重由33.1％上升为42.7％，贷款资金由38.9％下降为22.6％。2003年，国际金融公司（IFC）曾在做过问卷调查，30％的大型私营企业认为，金融问题是阻碍其的主要问题，40％的中小民营企业认为融资困难是影响发展的重要因素。民营企业在发展过程中一直被资金不足、融资渠道不畅所困扰。究其原因主要有：一是企业自身的原因。民营企业由于自身的实力和财务管理化的欠缺，往往达不到银行规定的信贷标准。而且，相当多的民营企业资信相对较差，企业和银行之间的信息不对称，取得抵押担保贷款困难。二是体制上的原因，民营企业与国有银行在所有制上的差异，造成了银行与企业之间的距离，银企联系不强，使民营企业获得贷款困难。
（2）投资活动方面：缺乏科学性，盲目追求多元化。
我国民营企业的老板懂市场、会营销、善交际的占80％以上，而擅长于企业内部管理的只占36％。换句话说，许多民营企业老板扮演的角色是高级采购员、营销员、公关先生，而不是企业家、经理。因此，民营企业在投资中经常表现出轻率和违背经济的行为，主要表现在企业盲目追求多元化经营上，只看到多元化经营所带来的分散风险作用和将企业规模做大的虚荣成就感，而忽略了企业扩张与其资金实力、技术开发、市场开拓及内部管理等方面的矛盾，忽略了跨地区、跨行业乃至跨国的多元化经营是需要条件的，且多元化经营也不一定能满足人们分散风险的初衷，反而可能导致财务分散、风险增大。事实证明，在世界经济500强中，没有几个企业是靠多元化经营安身立命的。
（3）日常经营活动方面：不注重流动资金管理，企业资金沉淀严重。
民营企业日常经营活动中的财务管理问题主要表现在：①对内对外资金管理不善，致使资金呆滞甚至流失。由于缺乏对客户经济实力的调查和信用的了解，草率发货，产生大额货款的长期挂账，催款无门。在供产销方面，民营企业大多缺乏统一指挥和计划，形成材料物资超储、成品库存积压严重，而且这些不良资产长期挂账，导致账实不符、财务状况虚假。②不注重日常现金流量的管理，营运资金波动大。很多民营企业缺少资金使用的长、中、短期计划，缺乏现金流量管理观念。特别是在经济繁荣时，企业可选择的机会多的时候，更容易忽视财务管理，盲目扩大生产规模，财务管理中存在的问题隐匿在盈利光环下。此外，许多企业在扩大规模新增固定资产时，动用日常周转的流动资金，压缩了营运资金，使资金紧张愈加突出，进而造成经营资金周转不灵，使企业无法正常运作。