（三）职务犯罪侦查中矛盾双方的强烈对抗性。在职务犯罪侦查中，一方面，侦查人员要依法开展侦查，查明犯罪人及其犯罪事实。另一方面，犯罪人却要千方百计对抗侦查，逃脱刑罚的处罚。即使在部分被告人自首的案件和过失职务犯罪案件中，依然存在这种对抗性，职务犯罪侦查矛盾双方的强烈对抗要求侦查人员必须强化策略意识，讲究斗争艺术，强调以智取胜。
（四）职务犯罪线索来源的隐蔽性。侦查实践表明，大多数职务犯罪的侦查始于群众举报的线索，线索来源的隐蔽性源于职务犯罪行为的隐蔽性、举报人怕受到打击报复等多因素。这一特点决定了立案前的审查阶段要花相当多时间和精力核查有无犯罪事实，而且能查实确有犯罪事实而立案侦查的匿名举报较少。鉴于此，要有效地侦查职务犯罪，就必须多渠道开辟线索来源，同时设法提高公开举报的比例，由此而相应提高举报线索的可靠性。
职务犯罪侦查取证过程的复杂性。职务犯罪行为触犯的法律、法规多，加之职务犯罪隐蔽，实施犯罪时间与发现犯罪的时间跨度大，故证实犯罪的直接证据和原始证据较少。因此，侦查取证的范围广泛，需要获取的证据数量多。就查帐而言，查帐人员可能要面对堆积如山般的帐册，检验完所有帐册的时间以月计的情况。再者，侦查对象反侦查的干扰阻力之大无疑增加了侦查取证的复杂程度。 田泽波