依法建章，还应当遵循合理性原则。在遵循法律优先原则，适当运用法律保留原则的前提下，高校对于学生的管理还存在着大量的自由裁量权空间。高校行使自由裁量权，不仅要合法，还应当受到合理性原则的制约。所谓遵循合理性原则，是指高校内部规则的制定、实施、规则内容、处分标准等均应体现公正合理的法理精神，例如不能因上课迟到而给予留校察看的处分。这实际是对“从严治校”这种管理理念的限制。如果不遵循合理性原则，学校的自由裁量权往往会打着“合法”的旗号而侵犯学生利益。但是在特别权力关系中学校内部管理规章未涉及学生基本权利的事项可能不具有可诉性，从而使这种自由裁量权有可能恣意妄为，学生的合理性的权益得不到有效救济和保障。合理性原则应该在我国相关法律法规中得到确认，或者提供一个意见，并在校规校纪的制定中得以体现。
在制定校规校纪的方式上，一般都是由学校单方面加以制定，从而使权利义务设定严重失衡。尽管学生没有法定的权利参与校规校纪的制定，但从学校民主管理的角度出发，应当允许学生参与讨论制定与自己密切相关的规章制度。这样可以集思广益，使学生意见和建议能通过正当途径得以表达，充分体现以人为本的管理理念，同时，在其实施过程中，会得到学生的尊重和支持，减少阻力，提高学生遵守的自觉性。
在校规校纪的内容上，应当设置明确合理、操作性强的程序条款，遵循正当程序原则。通过正当程序，可以控制管理过程，规范权力的运行秩序，把对学生实体性权利侵犯的危险降到最低。在现实中，学生涉嫌违反校规校纪，经过校方确认，就直接作出处理，中间没有允许学生就事实进行陈述以及申辩的机会，带有极大的随意性、武断性。对于关系学生重要利益处罚，一般应设置以下程序：学生管理部门对事实的调查取证程序；专门委员会举行听证会，听取学生陈述和申辩，并作出处罚的程序；处罚的执行等。对于一般的处罚，也要充分听取学生的陈述和申辩，防止权利滥用。不服从处罚的，可向学校及教育主管部门提出申诉。当然，正当程序不仅包括处罚学生的程序，管理过程中的某些方面也需要设置合理的程序，如学生的评优程序、学生干部的选拔任用程序等。
（四）完善学生权利救济制度
学生的权利救济属于正当程序的组成部分，应当在教育法律法规中加以规定，相关内容也应在各校的校规中得以体现。之所以单独列出，主要由学生救济性权利的重要性所决定。有权利必有救济，英国法学家韦德（H.W.R.Wade）曾精辟地指出这一点。[18]置言之，没有救济的权利是没有保障的权利，没有救济也就没有权利。由此可以看出权利救济的重要性。但对于这样重要的问题，我国相关法律法规却规定的相当原则和模糊，致使学生的救济性权利得不到有效保障。因此，从法治的角度对学生权利救济制度予以完善和重构，显得十分迫切。
（1）建立校内申诉制度，健全行政申诉制度
《教育法》第四十二条第四项规定：“对学校给予的处分不服向有关部门提出申诉，对学校、教师侵犯其人身权、财产权等合法权益，提出申诉或者依法提起诉讼；”《普通高等学校学生管理规定》第六十五条规定：“……处理结论要同本人见面，运行本人申辩、申诉和保留不同意见。对本人的申诉，学校有责任进行复查。”法律和规章尽管赋予了学生依法申诉的权利，但却没有规定如何行使的具体程序。为了依法保障学生申诉权利的实现，笔者认为应该建立校内申诉制度，健全行政申诉制度，并把这些制度在相关的教育法律法规中加以明确规定。
校内申诉制度，就高校学生管理来讲，是指学生因对学校有关职能机构或人员作出的有关处理决定不服，或认为其有关具体行为侵犯了自身的合法权益，申请学校依照规定程序进行审查处理的制度。学校应设立申诉委员会，受生的申诉请求。申诉工作程序包括申请审查、受理、直接听取争议双方的意见和理由，进行必要的调查工作，在此基础上依多数意见形成处理意见书，经学校批准后，正式作出申诉处理决定。校内申诉制度作为内部学生权利救济制度，在公正、合理的前提下，可以有效地把学校有关职能机构或人员与学生的纠纷消化在内部，避免教育行政主管部门或司法的介入，充分维护高校学生管理的秩序性和稳定性。