（四） 侵犯学生公正评价权。
《教育法》第四十二条第三项规定，受教育者享有：“在学业成绩和品行上获得公正评价，完成规定的学业后获得相应的学业证书、学位证书。”教育者对受教育者的评价应该客观公正，这既是学生的一项权利，也是教师师德的要求。1999年，刘燕文诉北京大学案，也从侧面反映出高校对学生评价的标准、程序方面存在着一些问题。武汉理工大学学生王某被学校认定为考试作弊，被留校察看一年。根据学校的学籍管理规定，在校期间受过留校察看处分者不能授予学士学位。王某毕业后时未被授予学士学位。毕业后，王某一纸诉状把母校高上法院。武汉洪山区法院一审判决：撤销留校察看一年的处分，并在判决生效之日起60日内，武汉理工大学对王某进行资格审核，做出是否颁发学士学位的决定。武汉理工大不服提出上诉。武汉市中级法院二审依法驳回上诉，维持原判。[6] “校规”终归大不过“部规”。《普通高等学校学生管理规定》第三十五条规定：“ 具有学籍的学生，德、体合格，学完或提前学完教学计划规定的全部课程，考核及格或修满规定的学分，准予毕业，发给毕业证书。本科生按照《中华人民共和国学位条例》规定的条件授予学士学位。”根据《学位条例》第四条规定：“ 高等学校本科毕业生，成绩优良，达到下述学术水平者，授予学士学位。（一）较好地掌握本门学科的基础理论、专门知识和基本技能；（二）具有从事研究工作或担负专门技术工作的初步能力。” 原《武汉大学学分制学籍管理暂行条例》第四十五条，“在校期间受过留校察看处分者不能授予学士学位”的规定与以上法律法规相抵触，当属无效。学位证书是对于学生学术水平的评价，而不是个人道德素质的评价，二者不能混淆。还有一些高校为了抓教学质量，强行规定本科生必须通过国家四级考试和机等级考试，才能授予学士学位，这也违反了《学位条例》的规定。
（五）侵犯学生程序性权利
《教育法》第四十二条第四项规定：“对学校给予的处分不服向有关部门提出申诉，对学校、教师侵犯其人身权、财产权等合法权益，提出申诉或者依法提起诉讼；”《普通高等学校学生管理规定》第六十四条规定：“对犯错误的学生，要热情帮助，严格要求。处理时要持慎重态度，坚持调查研究，实事求是，善于将思想认识问题同立场问题相区别，处分要适当。处理结论要同本人见面，允许本人申辩、申诉和保留不同意见。对本人的申诉，学校有责任进行复查。”由此可见，学生对于学校的处分享有被告知权、申辩权、申诉权、诉讼权等程序性权利。对学生的处分行为不仅内容上合法，即实体上合法，而且形式上也要合法，即程序上合法。实体上合法是管理行为公正、合理的基础，程序上合法是管理行为合法、有效的保证，这是程序正义原则的要求。然而，在学校学生管理中，“重实体，轻程序”的倾向明显，忽视对学生程序性权利的保护。田永诉北京大学案，其程序瑕眦可见一斑。学生程序性权利得不到保障的情形表现在以下三个方面：（1）高校的学生违纪处理条例中涉及违纪处理程序以及其它程序方面的内容偏少，措辞也较为原则、概括和模糊，操作性差；（2）在处分学生过程中，只体现学校管理者的单方意志，不注重调查取证，没有听证会，学生也没有机会申辩；（3）在事后救济方面，学生的申诉权也往往不能有效行使。教育行政部门和学校碍于各种利益往往互相推诿敷衍，使学生申诉无门。同时，由于目前法律的滞后性，学生的诉讼权也得不到有效保障。
（六） 侵犯学生的其它权利
学生作为公民，还享有法律、法规规定的其它权利，如人身自由、政治权利和自由、结婚权利、生育权利等。西安东郊一所大学在读女博士参加该校笔试时，发现自己有了身孕。按学校有关规定，在校女博士不能“做妈妈”，导师告诉如果想上博士，必须打胎。为了能够保住孩子，她跑遍了学校的相关部门，但无济于事，最后不得不做了人流手术。（见大河网2005年1月4日报道） 还有北京某高校女博士唐女士，怀孕后被迫放弃学业，因为该校规定研究生“在校期间不允许生育”。（据《北京晨报》2005年1月21日报道）《中华人民共和国人口与计划生育法》第三章第十七条规定：“公民有生育的权利”，这些学校的做法侵犯了她们的生育权、受教育权。在高考已经取消年龄限制的今天，高校校规中的“禁婚禁育”规定受到越来越多的挑战。原国家教委《普通高等学校学生管理规定》第三十条的内容：“在校学习期间擅自结婚而未办理退学手续的学生，作退学处理”，也违反了《婚姻法》的相关规定。