３月１０日举行的十届全国人大一次会议第三次全体会议，以绝对多数票通过了关于国务院机构改革方案的决定。
根据此次批准的方案，除了国务院办公厅，国务院２９个组成部门被调整为２８个，其中不再保留国家经贸委和外经贸部，其职能并入新组建的商务部。
２８个组成部门由此将共同构成下一届政府阵容。
１．外交部
外交部成立于１９４９年中华人民共和国成立后，是国务院负责全国外交工作的部门，代表国家和政府办理外交事务，对外发布国家重大对外政策和决定，公布国家外交文件和声明；负责外交谈判，签订有关条约、协定等外交文件；办理外交交涉；参加联合国和政府间的有关国际会议和国际组织的活动。
历任部长是周恩来、陈毅、姬鹏飞、乔冠华、黄华、吴学谦、钱其琛、唐家璇。
２．国防部
１９５４年９月第一届全国人大第一次会议决定设立国防部，隶属于国务院，是国务院主管全国国防工作的部门，负责掌管全国的国防事务。
历任部长：彭德怀、林彪、叶剑英、徐向前、耿飚、张爱萍、秦基伟、迟浩田（国务委员兼）。
３．国家发展和改革委员会
２００３年３月１０日，十届全国人大一次会议通过的国务院机构改革方案中指出，“现在的国家发展计划委员会将改组为国家发展和改革委员会，其任务是研究拟订经济和社会发展政策，进行总量平衡，指导总体经济体制改革”。
国家发展计划委员会系五年前根据九届全国人大一次会议通过的《关于国务院机构改革的决定》，由原来的国家计划委员会更名而来，主任是曾培炎。而国家计划委员会的历史就更长了，它成立于１９５２年１１月。１９５６年５月，从国家计委中又分出部分机构和人员成立国家经济委员会。其后，国家计委、经委几经分合。１９８８年４月撤销原国家计委和原国家经委，重新组建国家计划委员会。１９９４年３月国家物价局撤销后，并入国家计委，作为国家计委的内设职能司局。
历任国家计委主任有高岗、李富春、余秋里、姚依林、宋平、邹家华、陈锦华。
根据此次改革方案，“计划”二字将彻底从国家宏观调控部门的名称中淡出。国家发展和改革委员会将大力减少行政审批和微观管理事务，从而更好地发挥市场机制对经济活动的调节作用。
为减少部门职能交叉重复，提高工作效率，加强和完善宏观调控，现属国家经贸委的行业规划、产业政策、经济运行调节、技术改造投资管理、多种所有制企业的宏观指导、促进中小企业发展以及重要工业品、原材料进出口计划等职能，也将划归发展和改革委。此外，国务院体改办的职能亦并入国家发展和改革委员会。
４．教育部
教育部是国务院主管教育工作的综合部门。教育部原为国家教育委员会。１９４９年１０月新中国成立后，成立文化教育委员会、教育部；１９５２年１１月增设高等教育部、体育运动委员会、扫除文盲工作委员会；１９５４年扫除文盲工作委员会并入教育部。１９５８年２月高等教育部并入教育部。１９６４年７月恢复高等教育部。１９６６年７月高等教育部并入教育部。１９７０年６月中共中央决定撤销教育部，成立国务院科教组。
１９７５年１月第四届全国人大决定恢复教育部。１９８５年６月１８日全国人大六届十一次常委会决定撤销教育部，设立国家教育委员会。根据１９９８年３月１０日九届全国人大一次会议通过的《关于国务院机构改革的决定》，国家教育委员会更名为教育部。
历任国家教育委员会主任有李鹏、李铁映、朱开轩；历任教育部部长有马叙伦、杨秀峰、蒋南翔、刘西尧、何东昌、陈至立（女）。
５．科技部
科学技术部是国务院主管国家科学技术工作的部门 其前身是国家科学技术委员会，成立于１９５６年５月。１９５８年１１月２３日，第一届全国人大常委会１０２次会议决定撤销国家技术委员会，设立科学技术委员会。１９７０年６月２２日中央决定撤销该机构，１９７７年９月恢复科学技术委员会。１９７８年改为国家科学技术委员会。根据１９９８年３月１０日九届全国人大一次会议通过的《关于国务院机构改革的决定》，国家科学技术委员会更名为中华人民共和国科学技术部。